據教育部網站消息，自2011年到目前，中央財政已累計為營養改善計劃下撥專項資金803.93億元。其中：營養膳食補助資金271.81億元；食堂建設專項資金292.44億元；“一補”(家庭經濟困難寄宿生生活費補助)資金224.27億元；地方試點中央獎補資金15.41億元。

為督促各地管好用好這些資金，財政部、教育部印發了《農村義務教育學生營養改善計劃專項資金管理暫行辦法》，從資金安排、撥付、使用和監管等四個方面，對營養改善計劃中央專項資金管理進行了規范，要求各有關部門以資金安全為中心，按照“專款專用、公開透明、及時結算、年度平衡”的原則，按時撥付資金，加強使用管理，確保資金使用安全、規范和有效。